中心实行校、院二级管理，主管部门是学校实验室与设备管理处。由常景玲教授任中心主任，配备副主任2名。中心采取校企合作共建的方式，聘请合作企业技术骨干3名。成立包含校内外知名专家、相关学科的教师、合作企业的代表以及正副主任在内的虚拟仿真实验中心发展指导委员会。教学指导委员会负责出台学院虚拟仿真中心建设规划、审定各教学单位上报的实验资源建设计划、中心制度建设等，协调实验实训教学管理、监督检查、人员调配、经费划拨、资产调度等工作。实验中心负责实验中心的建设管理、实验实训教学管理、资产管理、日常管理、社会服务管理等；负责规定各教学单位的职责，负责实验实训教学计划管理、教学耗材的计划、实验实训教学实施和监控等。中心建立专职队伍对虚拟仿真实验教学系统进行建设、支持、更新与维护。中心根据教学需要，建立了实验中心实验专职教师队伍，更新教学资源，为新的实验课程提供制作教学资源的脚本。